《识骨寻踪》第九季继续讲述了警探布思（Booth）和人类学家布伦南（Brennan）携手探案的故事。两人在工作和生活中经常发生问题和摩擦，但又不由自主地被对方吸引，他们之间的感情在新一季中继续经受考验。以下是各集的简要剧情：
第1集：为美国国务院工作的会计师杰森遭人谋杀，其遗骸隐藏在一家旅馆楼顶的空调机组内，很难取出。杰斐逊学院团队介入调查，霍金斯（Hodgins）和黛西（Daisy）联手贡献智慧。
第2集：商业顾问亚当·帕克遭谋杀，尸骸被山猫吃得所剩无几。有证据显示专为夫妇开办的静修度假场所大有可疑，于是布伦南和布思决定假扮夫妇去卧底调查。他们在那里遇到了感情看起来过于完美的已婚夫妇比尔·舒马赫和伊夫林·舒马赫。
第4集：佩兰特（Pelant）归来，杰斐逊学院团队计划诱使他现身。他们对一具尸体动了手脚，使之吻合佩兰特的作案手法并大肆宣传该案，但计划造成了灾难性后果，一名与布思十分亲密的人惨遭毒手。同时，斯威茨（Sweets）回到团队，坚称海斯·弗林探员隐瞒了秘密，不能完全信任他。
第9集：著名球星基德曼杀妻案开庭审讯，布伦南作为陪审员被隔离。杰斐逊接手了基德曼案证人巴恩斯的残骸。尽管布伦南坚持基德曼是凶手，但因证据不足，基德曼被判无罪释放。最终，布伦南通过细致分析证据，查出是基德曼和妹妹艾莉森联手杀害了巴恩斯，基德曼在确凿证据下伏法。
第16集：海湾码头的湖中浮起一具腐尸，经证实死者莎莉是中情局招募的线人。布思和丹尼调查此案，嫌疑颇深的罪犯易卜拉欣却在多年前的一场爆炸中生死未卜。安琪拉确认了凶器，布思认出这是尼克的匕首，但尼克称莎莉是自己所爱之人。凯姆查出莎莉是被遗弃脱水致死，当年的监狱看守约翰内森才是真凶。约翰内森供出易卜拉欣手下的信息后被赦免，不甘的布思和尼克最终将他送上军事法庭。
第21集：有居民在沼泽地里发现一具尸体，杰斐逊的科学家们难以准确判断死亡时间。死者玛德琳为治疗女儿的疾病接触到“冷冻新星”，她死后因被低温冷冻导致内脏破裂。布伦南与布思先后调查了冷冻师沃肖和“冷冻新星”的诺亚与其妻子，一系列证据指向诺亚。原来诺亚一直暗恋着玛德琳，甚至在她死后将其冷冻，企图得到她的心。
第22集：又发生了一起与幽灵杀手有关的命案，死者是麦克纳马拉家族唯一的幸存者斯蒂芬妮。布思迫使美国证券交易委员会配合调查，发现斯蒂芬妮就是那名幽灵杀手，同时揭开了一起20年前的谋杀案。凯斯勒当年被斯蒂芬妮的父亲贾尔斯嫁祸入狱，出狱后展开报复行动。布思救下企图自杀的凯斯勒并将其逮捕，还获得了上司的举荐得到升职机会。
第20集：瀑布国家公园中藏着一具尸骨，安琪拉用新进的三维全息模拟技术还原出死者艾比的容貌。艾比生前患有严重的红斑狼疮，通过服用印度大麻缓解疼痛。癌症治疗有进展的温德尔回到杰斐逊，却因化疗期间服用大麻违反规定而被解雇。艾比生前在伯克医生的药房工作，暗中在此销售自己种植的大麻。查出凶器后，真凶大学生亚当浮出水面。在布思的帮助下，温德尔重新获得工作并有了自己的办公室。
其他剧集的剧情在上述参考内容中没有详细介绍，你可以通过观看电视剧来了解具体内容。如果你还想了解更多关于《识骨寻踪》第九季的信息，欢迎继续提问。
